Back

ⓘ InterPro




                                     

ⓘ InterPro

InterPro je baza podataka proteinskih familija, domena i funkcionalnih mesta na kojima su nadene prepoznatljive osobine poznatih proteina koje se mogu primeniti na nove proteinske sekvence da bi se funkcionalno karakterisale.

InterPro sadržaj je baziran na diagnostičkim potpisima i proteinima koji im u značajnoj meri odgovaraju. Potpisi se sastoje of modela koji opisuju proteinske familije, domene ili mesta. Modeli su izvedeni iz aminokiselinskih sekvenci poznatih familija ili domena. Oni su naknadno korišćeni za pretragu nepoznatih sekvenci kao što su one dobijene sekvenciranjem genoma sa ciljem njihove klasifikacije. Svaki član kolekcije InterPro baza podataka doprinosi različitoj niši, od veoma visokog nivoa, strukturno-bazirane klasifikacije SUPERFAMILY i CATH-Gene3D do veoma specifičnih klasifikacija potfamilija PRINTS i PANTHER.

                                     
  • tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR012569 Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR013210 Ovaj artikal sadrži tekst
  • direktor PROSITE, Swiss - Prot i Vital - IT grupa je Ioannis Xenarios. UniProt InterPro Predvidanja proteinske subcelularne lokalizacije De Castro E, Sigrist CJ
  • Curr. Biol. 9 18 R708 - 10. PMID 10508607. doi: 10.1016 S0960 - 9822 99 80446 - 1. Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR012919
  • olfactory mucosa Nat. Genet. 26 1 18 - 19. PMID 10973240. doi: 10.1038 79124. Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR004072
  • imaju bar jednu Pfam vezu. Taj broj se naziva pokrivenost sekvenci. TrEMBL InterPro Finn RD, Tate J, Mistry J, Coggill PC, Sammut SJ, Hotz HR, Ceric G, Forslund
  • ontologiju gena funkcionalne anotacije, Pfam anotaciju 1D sekvence i InterPro klasifikaciju domena, opis vezanih molekula, grafik koji prikazuje interakcije
  • class LIG BIR III 3 Eukaryotic Linear Motif resource motif class LIG BIR III 4 Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR001370
  • PMC 3071779 . PMID 21439056. doi: 10.1186 1546 - 0096 - 9 - 8. Jennifer McDowall Interpro Protein Of The Month: Fibrinogen. D Eustachio reactome: fibrinogen fibrin
  • 313 4 903 - 919. PMID 11697912. doi: 10.1006 jmbi.2001.5080. SCOP Pfam InterPro Proteinska familija Strukturni domen proteina SUPERFAMILY Spiricoil
  • Computational Chemistry. 4: 217 - 241. doi: 10.1016 S1574 - 1400 08 00012 - 1. InterPro IPR008209 Phosphoenolpyruvate carboxykinase, GTP - utilising Приступљено
  • dihydroorotate dehydrogenase на US National Library of Medicine Medical Subject Headings MeSH Ovaj artikal sadrži tekst iz javnog vlasništva Pfam i InterPro IPR001295